黄海水产研究所
水产育种与健康创新团队被山东省政府授予“第三批山东省优秀创新团队”荣誉称号
黄海水产研究所被青岛市授予2011年度“全市科技统计工作先进单位”
黄海水产研究所被青岛市授予2011年度“青岛市国家安全人民防线工作先进单位”
黄海水产研究所被青岛市委组织部授予“青岛市2011年度党内统计优秀单位”
黄海水产研究所被青岛市保密委员会授予“全市区域保密工作先进集体”
黄海水产研究所获“山东省R&D资源清查先进单位”荣誉称号
鱼类高效健康养殖模式与集成技术团队被青岛市总工会授予青岛市“工人先锋号”荣誉称号
鱼类养殖与设施渔业研究室被青岛市科协授予“青岛市科普工作先进集体”荣誉称号
工会被青岛市总工会授予“2011年度全市工会工作先进单位”、“体育拼搏奖和体育道德风尚奖”荣誉称号
工会被青岛市总工会授予“青岛市总工会经审工作规范化建设标准考核先进单位一等奖”
工会女工委被青岛市总工会授予“2011年度青岛市先进女职工委员会”荣誉称号
党委办公室被中共青岛市委统战部授予“党外代表人士队伍建设年”活动先进集体荣誉称号
九三学社基层委被九三学社青岛市委授予“2011年度参政议政一等奖”、“2011年度信息工作先进集体”荣誉称号
东海水产研究所
东海水产研究所被农业部东海区渔政局评为东海区渔业资源、环境监测网先进集体
东海水产研究所被农业部东海区渔政局评为东海区渔业资源动态监测网海区站、东海区渔业生态环境监测网先进集体
东海水产研究所被上海市杨浦区评为“安全行车先进集体”
东海水产研究所被上海市杨浦区评为“无偿献血先进单位”
第一团支部被上海市委农办评为优秀团支部
鱼类标本馆被中国水产学会评为先进科普基地
东海水产研究所被中国农学会农业产业化分会评为“中国农学会农业产业化分会2011-2012年度先进单位”
南海水产研究所
农业部南海区渔业生态环境监测中心被农业部渔业生态环境监测中心评为“2006-2010年度全国渔业生态环境监测工作先进集体”
黑龙江水产研究所
黑龙江水产研究所科研第二党支部获2011-2012年度黑龙江省直属机关“先进基层党组织“称号
长江水产研究所
农业部长江中上游渔业生态环境监测中心被农业部渔业生态环境监测中心评为“2006-2010年度全国渔业生态环境监测工作先进集体”
长江水产研究所被中共湖北省委省直机关工作委员会评为湖北省直机关第三届干部职工运动会“组织奖”单位
养殖党支部被中共湖北省委省直机关工作委员会评为2010-2012年创先争优“先进基层党组织”
珠江水产研究所
农业部珠江流域渔业生态环境监测中心被农业部渔业生态环境监测中心评为“2006—2010年度全国渔业生态环境监测工作先进集体”
珠江水产研究所被广东省档案局评为2012年度档案工作优秀奖
淡水渔业研究中心
淡水渔业研究中心被江苏省部署科研院所联合会评为“驻苏部属科研院所为江苏地方经济先进集体”
淡水渔业研究中心被无锡市政府评为无锡专利工作优胜单位
《科学养鱼》杂志社被中国水产学会评为先进集体
九三学社淡水中心支社被九三学社中央委员会评为“学习践行社会主义核心价值体系全国先进集体”
渔业机械仪器研究所
渔业机械仪器研究所被评为2011年度上海市平安示范单位
渔业机械仪器研究所获得2012年度杨浦区人才发展专项资金(鼎元资金)重点领域人才开发类资金资助
渔业机械仪器研究所被评为2011年度杨浦区社区、企事业单位无偿献血工作考核优秀集体
团总支被评为上海市委农办系统五四红旗团支部
青年志愿团队被评为2011年度四平路社区十佳志愿者团队
《渔业现代化》杂志被评为上海市期刊编校质量优秀奖
院部
中央国家机关精神文明建设协调领导小组办公室明确我院继续享有“中央国家机关文明单位”称号
中国水产科学研究院获农业部2010-2012年度文明单位称号
鲟鱼繁育技术工程中心被命名为农业部青年文明号
中国水产科学研究院被农业部评为2012年度平安建设优秀单位
中国水产科学研究院被农业部渔业局评为2011-2012年度全国渔业政务信息与宣传工作先进单位
中国水产科学研究院被评为2011年度部直属机关党建宣传信息工作先进单位
中国水产科学研究院2011年度资产类决算工作获农业部财务司通报表扬
中国水产科学研究院2011年5月-2012年4月预算管理工作被农业部财务司评为二等奖
中国水产科学研究院在2012年农业基建项目专项检查信息报送考核中排名第一
中国水产科学研究院被农业部离退休干部局评为2011年宣传信息工作先进单位
院机关党委被评为2010-2011年度农业部直属机关先进基层党组织
院机关工会获2009-2011年度农业部直属机关优秀工会工作奖
院机关团委获2009-2011年度农业部直属机关先进基层团组织称号
《中国水产科学》被中国学术期刊(光盘版)电子杂志社评为2012中国国际影响力优秀学术期刊
《中国水产科学》被中国科学技术信息研究所评为2011年百种中国杰出学术期刊、2011年度中国精品科技期刊
北京鑫洋公司被北京市兽药协会评为北京市兽药生产企业十强
中国水产科学研究院被农业部农产品质量安全监管局评为2012年农业部中青年干部学习论坛“强监管 保质量”分论坛优秀组织单位
中国水产科学研究院获农业部系统干部职工“英语之星”风采大赛团体赛三等奖
中国水产科学研究院在农业部乒乓球比赛中获直属单位组团体总分第二名
中国水产科学研究院在农业部健步走比赛中获直属单位三等奖
老干部象棋队在农业部老干部象棋比赛中获得团体第三名和个人第二名
“卡露伽(KALUGA QUEEN)”牌鱼子酱被中国农产品品牌大会组织委员会评为中国农产品品牌博览会优质农产品金奖;被浙江省人民政府办公厅评为2012浙江农业博览会金奖;被杭州市对外贸易经济合作局评为杭州市出口名牌;被杭州市工商行政管理局评为杭州市著名商标