根据中越两国政府于2000年12月25日签署并于2004年6月30日生效的《中越北部湾渔业合作协定》，中越两国政府在共同渔区内将进行长期的渔业合作，并定期开展渔业资源联合调查。联合调查项目受到两国政府和国家最高领导人的高度关注。我院南海所从2005年起开始承担“中越北部湾共同渔区渔业资源联合调查”这项重要而艰巨的任务，目前已出色地完成了五个航次共260站次调查任务，获得调查数据6万多个。第六航次调查于2007年4月1日顺利开航，预计4月底完成，孙典荣同志担任本次航次首席科学家，中越双方共7名渔业资源和生态环境方面的专家参加联合调查。

北部湾渔业资源调查也是我国渔业管理部门掌握渔业资源状况和变动趋势的需要，通过调查，将为《协定》实施后北部湾渔业产业结构调整及各项渔业管理措施的实施提供重要科技支撑。