根据2011年版中国科技期刊引证报告（扩刊版）的数据，我院南海水产研究所主办的学术期刊《南方水产科学》（2011年由原《南方水产》更名）的影响因子达1.585，在全国全部23种水产渔业类期刊中仅次于《中国水产科学》（1.930）和《水产学报》（1.588），列第三位，比2010年版在同类期刊影响因子的排名提升了3位，显示出期刊的编辑质量和学术影响力有了明显的提升。这是《南方水产科学》继2011年4月首次入选“RCCSE核心期刊”后，取得的又一佳绩。

《南方水产科学》期刊编辑部表示，这一成绩的获得与读者、作者、审稿专家的大力支持与共同努力是分不开的，编辑部将以此为契机，再接再厉，进一步提升期刊的学术质量，提高服务水平和工作效率，力争再创佳绩，为水产科研工作者搭建一个高水平的学术交流平台。