大口黑鲈是我国重要的淡水养殖品种，2023年全国养殖产量达到88.80万吨，在国民经济中占有重要地位。目前大口黑鲈国审新品种仅有2个，新品种的数量与大口黑鲈养殖产业规模不匹配。亟需开发新的新品种，尤其是具有抗逆等性状的新品种。研发创制基因组芯片，可以为加速大口黑鲈的育种进程，提高育种效率奠定基础。

中国水产科学研究院珠江水产研究所鳜鲈基因组学与选择育种创新团队与康普森生物技术有限公司合作，利用CAGT®（Compass Agriculture Genomic Technology）靶向捕获测序技术，研发了具有自主知识产权的大口黑鲈50 K液相育种芯片“鲈芯1号”。该芯片可应用于大口黑鲈种质资源鉴定、遗传多样性评估、基因定位与挖掘鉴定、全基因组关联分析、分子辅助定向改良和基因组育种等不同场景，为大口黑鲈遗传研究和品种选育提供了高效基因型鉴定工具。利用该芯片将来可进一步研发低密度芯片，降低选育成本，助力大口黑鲈全基因组选育和良种创新研究。

该芯片位点多态性高、基因组分布均匀，位点在染色体上的平均覆盖率为99.65%，平均间距17 Kb。性状关联位点丰富，芯片包括团队前期研究筛选获得的多个功能位点，可用于生长、性别和抗病毒等重要性状的精准鉴定和生产应用。“鲈芯1号”技术性能优良，而且芯片稳定性好，基因分型准确度高，测试结果显示平均位点检出率达99.95%，重复样本基因型平均一致率为99.95%。

负责“鲈芯1号”研发的核心成员包括岗位科学家高风英特聘研究员，董浚键助理研究员、孙成飞副研究员、叶星研究员等。“鲈芯1号”的研制得到国家特色淡水鱼技术体系淡水鲈种质资源与品种改良岗位（CARS-46）、中国水产科学研究院基本科研业务费（2023TD95）等项目的支持。

图1 大口黑鲈50 K育种芯片检测试剂盒

图2 大口黑鲈50K CAGT液相育种芯片标记位点在染色体上的分布

图3 “鲈芯1号”检测效果