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珠江所对鱼类DNA 条形码数据库的开发取得进展
2024-06-05 16:56:47  来源:珠江水产研究所

近日,珠江水产研究所观赏渔业研究室在国际学术期刊《Database》(JCR 1区,IF2022=5.8)在线发表“CoSFISH: a comprehensive reference database of COI and 18S rRNA barcodes for fish”的研究论文。该研究得到了中国-东盟海洋合作基金(CAMC-2018F)、2022年省级乡村振兴战略专项种业振兴行动(2022SBH00001)和国家淡水水产种质资源库(FGRC18537)等项目资助。珠江所为论文第一单位,王媛媛博士为第一作者,牟希东研究员为通讯作者。

鱼类种类繁多,准确的物种鉴定是不可或缺的基础,构建一个详尽的鱼类参考数据库是必要的。在国家淡水水产种质资源库珠江分库和广东省淡水水产种质资源库基因库的基础上,结合从FishBase网站收集基本的鱼类物种信息,建立了一个包含线粒体基因COI和核基因18S rRNA条形码的鱼类综合参考数据库——CoSFISH。CoSFISH包含了21535条COI条形码和1074条18S rRNA条形码,涵盖了21589种鱼类,分别隶属于8个纲和90个目。这一数据库的建成为鱼类多样性、系统发育学和生物进化研究提供了数据支撑。

全文链接:https://doi.org/10.1093/database/baae038

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